Как определить причину высокой нагрузки на VDS и какие инструменты использовать?

На VDS наблюдается сильная нагрузка. Как выяснить, что именно нагружает система? Какие утилиты помогут определить источник? Нужно ли смотреть нагрузку на процессор, память, диск или сеть? Как интерпретировать вывод htop и iotop? Какие типичные причины нагрузки для разных приложений?