0
Заметной разницы обычно нет, оверхед минимальный. У меня питон в докере работает так же шустро как и на голой системе, если не накосячить с вольюмами и лимитами по памяти/CPU. Иногда тормозит I/O если папки проброшены через vboxsf или типа того. В целом, не парься.