Может ли подобная разметка H1 иметь проблемы со стороны SEO?

Да, если H1 больше одного или он напихан ключевиками без смысла, то поисковики могут неправильно понять, о чём страница. Гугл вроде говорит, что множественные H1 не критичны, но на практике лучше один чёткий заголовок, отражающий суть текста. И точно не стоит их скрывать или делать кликабельными только для роботов — за такое могут и пессимизировать.