Как сделать из vds и домена полноценный сайт?

Ну смотри, всё просто: покупаешь VDS, привязываешь к ней домен через A-запись (указав IP сервака в настройках домена), ставишь веб-сервер (Apache/Nginx) и закидываешь файлы сайта в /var/www. Если не хочешь возиться с консолью, поставь панель типа FastPanel — она всё за тебя настроит.