0
Я просто в панели регистратора каждому домену прописываю одинаковые NS-сервера, и всё. Если доменов много, можно через API массово поменять, но обычно руками недолго. Некоторые панели позволяют скопировать настройки с одного домена на другие.
Стоит различать два уровня. NS у регистратора — это делегирование; одинаковый набор серверов там ещё не значит, что домен заработает. Провайдер DNS должен держать зону для каждого домена, иначе резолверы получат REFUSED или SERVFAIL. Поэтому сначала создайте зоны у DNS-провайдера (или в своей панели), потом меняйте NS.
Если серверы свои, добавьте каждую зону в конфиг, а для вторичного — разрешите трансфер по ACL и NOTIFY, иначе копия не обновится. Когда NS лежат в домене самих серверов (ns1.example.net), у регистратора нужны glue-записи с IP, иначе часть резолверов не сможет их разыскать.
Проверяйте по каждому домену: запрос NS к публичному резолверу и трассировку от корня, плюс совпадение NS в SOA и в самой зоне. Массовые правки через API или CSV делайте сначала на одном домене как на пилоте.